Нашел решение, которое помогло мне решить проблему со значком в панели около часов. Решение оказалось универсальным и подошло для Skype и для Viber. Возможно для каких-то еще приложений тоже подойдет.
Взято тут.
Открываем терминал и выполняем следущую команду:
sudo apt install sni-qt:i386
И перезапускаем Skype или Viber.
Удачи! 100% работоспособность не гарантируется.